Електронне адміністрування ПДВ забезпечує автоматичний облік платників податку щодо: сум податку, що містяться у виданих та отриманих податкових накладних, зареєстрованих в Єдиному реєстрі податкових накладних (ЄРПН), і розрахунках коригування до них; сум податку, сплачених платниками під час ввезення товарів на митну територію України; сум поповнення й залишку коштів на рахунках у системі електронного адміністрування ПДВ; суми податку, на яку платники мають право зареєструвати податкові накладні в ЄРПН. Орган ДФС для сплати податку до бюджету надсилає органу казначейства, що здійснює обслуговування бюджетних коштів, в якому відкриті рахунки платників у системі електронного адміністрування ПДВ, реєстр платників із визначенням: назви платника, податкового номера й індивідуального податкового номера платника, звітного періоду та суми податку, що підлягає перерахуванню до бюджету. Електронні рахунки відкриваються й обслуговуються органами казначейства на безоплатній основі. Інформація про рух коштів на електронних рахунках за відповідним запитом платника податку надається ДФС України безоплатно незалежно від кількості запитів і без обмеження в часі. Протягом періоду дії в тестовому режимі (із 1 січня до 1 липня 2015 року) системи електронного адміністрування ПДВ платники податку самостійно зараховують на такі електронні рахунки кошти із власних поточних рахунків, відкритих у банківських установах, у сумах, необхідних для сплати до бюджету узгоджених податкових зобов"язань із цього податку, задекларованих ними в податковій звітності із ПДВ. Слід зауважити, що визначені зміни в Податковому кодексі України не стосуються кола платників ПДВ, об"єкту оподаткування, принципів адміністрування податку, формування податкових зобовязань і податкового кредиту.